服务器安装R

服务器非root权限安装R

        Linux系统通常会自带Perl和python，但是一般情况下不会自带R语言。虽然绝大多数时候R语言都是安装在本地PC端进行数据分析。但是在服务器上安装R语言可以有事半功倍的效果。目前很多教程甚至是培训机构都在教如何用root权限在Linux上安装R，事实上绝大多数学生都不会有root权限。

下载地址及安装方法

       在百度或者Bing搜索R for Linux

wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.5.3.tar.gz
tar -xvf R-3.5.3.tar.gz
cd R-3.5.3/
./configure prefix=/home/xiongdy/software/R/R-3.5.3
make
make install
echo 'PATH=$PATH:~/software/R/R-3.5.3/bin' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

        编译时间较长，耐心等待即可。

安装常用R语言包

        如果不选择R包安装源的话会默认使用国外的官方源，使用官方源的缺点是下载速度非常慢。所以编译安装好R在下载软件包前先修改源，然后再下载

R

        如果出现以下界面则是在正常下载。


效果
       下图则是在服务器上配合其他NGS软件利用R语言做出的冗余序列分布图


                                                        
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